Activitatea Secţiei Sănătatea în Relaţie cu Mediul este orientată spre crearea unui sistem de supraveghere de stat a sănătăţii publice în mun.Chişinău, în funcţie de calitatea factorilor de mediu, trai şi odihna şi respectarea regulamentelor sanitare, altor acte normative şi directive în domeniul supravegherii de stat a sănătăţii publice de către instituţii, organizaţii, unităţi economice, persoane juridice şi persoane fizice.

Efectuează supravegherea şi controlul respectării de către agenţii economici, insituţii, servicii, departamente etc. a prevederilor actelor legislative şi normative ce stabilesc cerinţe obligatorii privind sănătatea publică.

Supraveghează starea sanitaro-epidemiologică a obiectivelor mediului ambiant, de habitat, în domeniile de prestări servicii, comerţ cu mărfuri industriale, distracţie, odihnă, sport, instruire şi educaţie pentru maturi, şi respectării condiţiilor sanitare de funcţionare ale acestora.